1978 年，湖南省农业厅成立省种子公司。

1996 年，湖南省种子公司转变为湖南省种子集团公司。

1997 年，湖南省种子集团公司、省生物药厂、省棉科所等组建湖南省农业集团公司。

1998 年 8 月，湖南省农业集团作为主发起人、联合南山牧场、高溪集团组建湖南亚华种业股份有限公司， 1999 年 6 月在深交所挂牌上市。

1998 年 8 月，湖南省农业集团公司旗下的湖南省种子集团公司、湖南省蔬菜技术服务站和湖南省棉花科学研究所进入湖南亚华种业股份有限公司。湖南省种子集团公司以除果蔬部外的人员和资产组建湖南亚华种业股份有限公司粮油种子分公司。湖南省种子集团公司果蔬部和湖南省蔬菜技术服务站联合组建湖南亚华种业股份有限公司蔬菜花卉种子分公司。湖南省棉花科学研究所科技服务部组建湖南亚华种业股份有限公司棉花种子分公司。

2002 年 2 月，粮油种子分公司与蔬菜花卉种子分公司合并组建湖南亚华种业股份有限公司种子种苗分公司。

2004 年 9 月， 湖南亚华种业股份有限公司以其种子种苗分公司的水稻、玉米、油菜种子生产经营性的部分优质净资产和湖南亚华种业科学院的净资产为主体，联合科研、生产、经营骨干发起成立湖南亚华种子有限公司。